More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0474 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  71.14 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  46.34 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  37.81 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  37.15 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  43.95 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.57 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  42.6 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.89 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  44.72 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  41.79 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.5 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.77 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.8 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  33.8 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.8 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  30.13 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  38.65 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  31.1 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  33.1 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  33.57 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  25.59 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  32.14 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  36.62 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  42.86 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  32.17 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  40 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1457  Methyltransferase type 12  37.35 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  42.52 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.28 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  34.75 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  41.22 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  35.93 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  27.64 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  31.84 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  41.73 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  42.28 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.73 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  48.35 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  25.13 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  48.35 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.71 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.66 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  33.56 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  47.25 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  30.35 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.88 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  35.17 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  34.85 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.27 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.33 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  35.66 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.82 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  31.78 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  42.59 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  40.4 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  26.28 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>