More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1347 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  62.73 
 
 
720 aa  913    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  62.15 
 
 
726 aa  904    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0682  heavy metal translocating P-type ATPase  60.22 
 
 
741 aa  910    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0741733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
730 aa  1476    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  51.81 
 
 
739 aa  756    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0610  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
719 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.424082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
866 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  41.97 
 
 
826 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
836 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
797 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
797 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
798 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
845 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
837 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
894 aa  502  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
818 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
889 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
889 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
796 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.02 
 
 
794 aa  491  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 
798 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
752 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 
798 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
743 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
750 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1383  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
745 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.457805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 
837 aa  485  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
836 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
802 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  37.58 
 
 
898 aa  485  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
815 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
802 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  38.37 
 
 
805 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
839 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  37.55 
 
 
838 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  36.55 
 
 
742 aa  480  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
759 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.12 
 
 
753 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
758 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
831 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
759 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
803 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  37.21 
 
 
826 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
814 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
826 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  36.98 
 
 
828 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
828 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
833 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
837 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
827 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
852 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  36.02 
 
 
819 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
794 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.63 
 
 
805 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.64 
 
 
805 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
759 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
804 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
835 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  38.76 
 
 
805 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.8 
 
 
942 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
759 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
827 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
828 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
831 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  38.63 
 
 
805 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  38.5 
 
 
805 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  34.65 
 
 
760 aa  465  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
790 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
840 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  38.63 
 
 
805 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
909 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  36.85 
 
 
750 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
839 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  38.56 
 
 
860 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
833 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  38.5 
 
 
806 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
806 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
841 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
724 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  37.18 
 
 
741 aa  462  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  35.46 
 
 
811 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  35.46 
 
 
811 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
806 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36.55 
 
 
767 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
762 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  34.54 
 
 
747 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
762 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  36.64 
 
 
724 aa  458  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
821 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.79 
 
 
758 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
762 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  35.6 
 
 
786 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
1071 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
1087 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
793 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  36.81 
 
 
762 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  37.52 
 
 
782 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  35.18 
 
 
841 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.69 
 
 
839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>