33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0309 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  758    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0644  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  27.53 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  19.34 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.12 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 466 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  29.7 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  22.92 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  19.81 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  30.61 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  30.61 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.32 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  30.61 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  19.05 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>