42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0644 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0644  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  870    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1341  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  24.94 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  31.82 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  30.63 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.22 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.22 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 406 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2069  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.47 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.58 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  32.29 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  29.1 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.23 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  32.33 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  26.71 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  26.71 
 
 		 384 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  24.9 
 
 		 360 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>