More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4451 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 
369 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.16 
 
 
360 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.05 
 
 
360 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  61.5 
 
 
359 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  62.05 
 
 
360 aa  461  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  60.61 
 
 
364 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  60.61 
 
 
362 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  57.18 
 
 
362 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  52.45 
 
 
369 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  48.48 
 
 
357 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  48.04 
 
 
360 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.77 
 
 
360 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.49 
 
 
360 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  49.72 
 
 
368 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.52 
 
 
360 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  47.92 
 
 
364 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.37 
 
 
364 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
364 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
366 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  46.28 
 
 
371 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.15 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.6 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.6 
 
 
366 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  46.54 
 
 
365 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  47.11 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  46.41 
 
 
441 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45.88 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  43.24 
 
 
375 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.13 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  43.56 
 
 
370 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  45.73 
 
 
365 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  42.51 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.62 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  43.53 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  43.09 
 
 
366 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  45.21 
 
 
366 aa  299  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  42.38 
 
 
351 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  42.31 
 
 
369 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.82 
 
 
364 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.99 
 
 
364 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.54 
 
 
363 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.32 
 
 
362 aa  292  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.78 
 
 
430 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  43.21 
 
 
360 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.27 
 
 
363 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.27 
 
 
363 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.27 
 
 
365 aa  288  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  40.73 
 
 
389 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.33 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.72 
 
 
363 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  40.38 
 
 
367 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  41.99 
 
 
350 aa  279  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  41.73 
 
 
375 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  42.58 
 
 
372 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  38.63 
 
 
367 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.58 
 
 
376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.84 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.19 
 
 
369 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.19 
 
 
369 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  40.06 
 
 
361 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  40.11 
 
 
371 aa  269  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.42 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  42.11 
 
 
356 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.84 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3756  glycine cleavage system T protein  39.89 
 
 
363 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.33646  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  36.41 
 
 
365 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0155  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.843588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  37.5 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0136  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.62 
 
 
368 aa  259  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.46 
 
 
362 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  35.28 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.86 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  37.43 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.46 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  36.31 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0446  glycine cleavage system T protein  38.96 
 
 
361 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.190481  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.39 
 
 
374 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  41.08 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.21 
 
 
362 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.71 
 
 
365 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  37.57 
 
 
364 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  38.13 
 
 
378 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.89 
 
 
365 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.87 
 
 
370 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  39.78 
 
 
363 aa  246  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  35.73 
 
 
362 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.47 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.85 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  34.59 
 
 
363 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.27 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  36.75 
 
 
401 aa  242  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33040  glycine cleavage system protein T2  38.44 
 
 
373 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000417127  hitchhiker  0.000519847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.04 
 
 
371 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26050  glycine cleavage system T protein  38.92 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>