More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4162 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4162  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  326  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.413658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0362  CinA domain protein  47.77 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  0.424027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1723  CinA domain protein  43.88 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0236925  hitchhiker  0.000170556 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2475  CinA-like  41.33 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  32.14 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.06 
 
 		 413 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  33.33 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  35.11 
 
 		 420 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  28.97 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.99 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  30.56 
 
 		 408 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  34.56 
 
 		 403 aa  77.8  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.04 
 
 		 433 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  26.57 
 
 		 415 aa  77.4  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  32.84 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.34 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  29.37 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  29.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  28.67 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  33.08 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  30.37 
 
 		 362 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  29.93 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  30.83 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  34.15 
 
 		 414 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  31.33 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  35.78 
 
 		 418 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  27.97 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  28.15 
 
 		 413 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  30 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  30 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  27.41 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  31.16 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  33.09 
 
 		 408 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  31.93 
 
 		 416 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  30 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.82 
 
 		 424 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  25.17 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  28.99 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  30 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  29.66 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  30 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.2 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.79 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  27.74 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  31.03 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  31.03 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  30.88 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  30.88 
 
 		 421 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  32.82 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  30.88 
 
 		 421 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  32.41 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  28.03 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  29.2 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  29.08 
 
 		 408 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  32.88 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  28.17 
 
 		 413 aa  68.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  29.8 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  27.94 
 
 		 414 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  28.68 
 
 		 414 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  32.87 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  28.17 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  36.7 
 
 		 431 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  29.5 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  29.93 
 
 		 415 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  30.88 
 
 		 422 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  29.5 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  30.71 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 414 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  30.2 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  33.33 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 417 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.23 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  30.94 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  27.59 
 
 		 411 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  33.03 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.03 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  26.27 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  27.08 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4309  CinA domain protein  31.88 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0711845  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  30.57 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  29.17 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  28.33 
 
 		 412 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  29.45 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  29.45 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  27.08 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  28.97 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  29.77 
 
 		 414 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  29.45 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  29.19 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  27.91 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  30.58 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  27.41 
 
 		 413 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  28.1 
 
 		 412 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  31.78 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  29.51 
 
 		 417 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  28.77 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  27.73 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  29.05 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>