28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2150 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  37.65 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  36.14 
 
 
874 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  44.83 
 
 
919 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  40.91 
 
 
827 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  32.98 
 
 
669 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  32.39 
 
 
1093 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  29.73 
 
 
1441 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  29.67 
 
 
1437 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0049  hypothetical protein  30.26 
 
 
1449 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000651101  normal  0.0482632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  31.25 
 
 
1170 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  27.5 
 
 
1031 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  31.78 
 
 
655 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  27.84 
 
 
3089 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.25 
 
 
533 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  32.1 
 
 
861 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  35.37 
 
 
700 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  27.34 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  40.82 
 
 
657 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  27.63 
 
 
469 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.19 
 
 
1345 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05425  hypothetical protein  26.98 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  31.51 
 
 
112 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  28.31 
 
 
1133 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  24.32 
 
 
1024 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  28.74 
 
 
887 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  28.71 
 
 
595 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  28.71 
 
 
588 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>