More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1538 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1538  single-strand binding protein  100 
 
 		 146 aa  306  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02665  single-strand DNA-binding protein  69.3 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0979  single-strand binding protein  60.83 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  40.12 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 222 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.17 
 
 		 163 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  33.12 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.83 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  33.77 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 176 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.07 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 186 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  37.84 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 173 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 180 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  39.04 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.73 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  40 
 
 		 230 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 199 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 185 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 185 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.45 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 170 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 179 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 184 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  40 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.88 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 196 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 183 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 181 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 180 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  38.64 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  37.68 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  43.12 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  38.32 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 181 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  38.19 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.16 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  43.12 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  38.32 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 186 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 178 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 173 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  43.69 
 
 		 167 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  38.41 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 174 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  37.68 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  42.72 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  45.22 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  42.72 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 181 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>