More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0979 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0979  single-strand binding protein  100 
 
 		 140 aa  292  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1538  single-strand binding protein  60.83 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02665  single-strand DNA-binding protein  60.17 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.6 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  45.87 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 188 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  41.13 
 
 		 180 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 182 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 185 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 186 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 179 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 184 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 199 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 166 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 192 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 196 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 192 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 222 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 186 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 184 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 187 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  36.03 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  40 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.9 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  36.15 
 
 		 175 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.9 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 173 aa  94.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  32.03 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 176 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  40.19 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  34.23 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  43.81 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  34.75 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  37.31 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 167 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.09 
 
 		 190 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  41.24 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 181 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  39.52 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  44.12 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  42.27 
 
 		 182 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  34.53 
 
 		 168 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 167 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 184 aa  90.1  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 180 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  32.81 
 
 		 175 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 168 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  41.24 
 
 		 181 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  40.2 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 214 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 185 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  32.37 
 
 		 175 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  40.2 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 183 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 181 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  40.2 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  40.21 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  42.27 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  33.11 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 167 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.24 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  38.24 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>