32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0837 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 92 aa  183  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  73.68 
 
 		 79 aa  95.9  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  58.75 
 
 		 336 aa  90.5  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  52.33 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  59.76 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  51.14 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  54.02 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  45.35 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  58.62 
 
 		 253 aa  73.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  37 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  46.91 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  56.9 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  46.84 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  51.47 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  57.63 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  41.38 
 
 		 265 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  51.56 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  38.27 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  37.93 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  40.98 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  40.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  32.73 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  36.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  43.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  43.33 
 
 		 194 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  38.16 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>