More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3256 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  83.54 
 
 
401 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  83.54 
 
 
401 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  83.54 
 
 
401 aa  690    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  83.54 
 
 
401 aa  691    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  83.54 
 
 
401 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  82.79 
 
 
401 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  83.29 
 
 
401 aa  690    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  82.79 
 
 
401 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  83.29 
 
 
401 aa  688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  82.79 
 
 
401 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  82.54 
 
 
401 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  83.79 
 
 
401 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  82.79 
 
 
401 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  83.29 
 
 
401 aa  688    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 
401 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  72.57 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  67.83 
 
 
401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  68.08 
 
 
401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  67.83 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  69.83 
 
 
401 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 
401 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 
401 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 
401 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  49 
 
 
403 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  49.12 
 
 
404 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  46.17 
 
 
405 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  48.99 
 
 
403 aa  361  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  46.25 
 
 
399 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.84 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.5 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.32 
 
 
414 aa  335  7e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.1 
 
 
417 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 
404 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.46 
 
 
417 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.89 
 
 
420 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.52 
 
 
451 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.56 
 
 
429 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.56 
 
 
429 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.84 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.33 
 
 
407 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.58 
 
 
407 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.72 
 
 
413 aa  326  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 
413 aa  325  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.43 
 
 
408 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.92 
 
 
425 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  43.98 
 
 
405 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.25 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.25 
 
 
429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 
413 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  42.44 
 
 
413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.32 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.68 
 
 
405 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.42 
 
 
405 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.38 
 
 
412 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.68 
 
 
406 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40 
 
 
569 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.95 
 
 
406 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.94 
 
 
657 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.58 
 
 
427 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  43.22 
 
 
404 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.6 
 
 
406 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  42.68 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.18 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.46 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.35 
 
 
406 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43.49 
 
 
414 aa  312  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  312  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.89 
 
 
662 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.52 
 
 
413 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.16 
 
 
406 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.11 
 
 
408 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.12 
 
 
410 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.39 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.57 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.8 
 
 
408 aa  308  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.09 
 
 
408 aa  308  8e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  40.5 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  38.78 
 
 
420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.7 
 
 
414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.35 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.39 
 
 
409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.45 
 
 
404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  40.25 
 
 
420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.09 
 
 
605 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.21 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  42.07 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.25 
 
 
412 aa  306  6e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.86 
 
 
417 aa  305  7e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.75 
 
 
664 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43 
 
 
672 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.95 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  40.85 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>