29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1342 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1342  bacteriophage CI repressor  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453655  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2793  CI repressor  52.94 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.0967608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0911  putative bacteriophage CI repressor protein  53.48 
 
 		 189 aa  221  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000321718  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00833  hypothetical protein  52.41 
 
 		 189 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00817  Repressor protein  53.01 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.392805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0883  CI repressor  41.14 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0877  CI repressor  35 
 
 		 288 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.277312  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2082  CI repressor  31.87 
 
 		 287 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3154  CI repressor  35.39 
 
 		 285 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1837  CI repressor  31.82 
 
 		 270 aa  121  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3513  bacteriophage CI repressor  33.73 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0780259  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3505  repressor protein  33.85 
 
 		 137 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.07388e-18 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05009  hypothetical protein  25.51 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0700  bacteriophage CI repressor  23.96 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3065  phage repressor protein cI  27.08 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1076  putative bacteriophage CI repressor protein  23.74 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1269  bacteriophage CI repressor  24.87 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2950  repressor protein  27.27 
 
 		 95 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132196  hitchhiker  1.92904e-20 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1586  putative PAS/PAC sensor protein  44.83 
 
 		 541 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.822014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2707  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 		 640 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  23.44 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1615  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0506  hypothetical protein, putative phage gene  26.13 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0589697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1994  putative PAS/PAC sensor protein  39.66 
 
 		 543 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.48 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0420  CI repressor  31.15 
 
 		 116 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 129 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  32.76 
 
 		 219 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>