256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0403 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4673  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.46 
 
 		 828 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02262  predicted outer membrane export usher protein  50.95 
 
 		 881 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0233  fimbrial usher protein  51.02 
 
 		 885 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.516859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3089  fimbrial usher protein  50.62 
 
 		 881 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2632  fimbrial usher family protein  51.32 
 
 		 881 aa  865    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0217  fimbrial usher protein  50.9 
 
 		 885 aa  875    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.609825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3172  fimbrial usher protein  50.74 
 
 		 881 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.287175  normal  0.39987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0825  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.67 
 
 		 845 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4723  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  59.25 
 
 		 844 aa  1018    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3480  fimbrial usher protein  50.42 
 
 		 860 aa  849    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0232  fimbrial usher protein  50.78 
 
 		 885 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0252  fimbrial usher protein  46.53 
 
 		 826 aa  783    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00772695  hitchhiker  0.00000864074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0403  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 835 aa  1724    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0215  fimbrial usher protein  50.9 
 
 		 885 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00519356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2717  fimbrial usher family protein  51.14 
 
 		 880 aa  866    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.405081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0695  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  46.29 
 
 		 826 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1315  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.44 
 
 		 881 aa  867    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0614  fimbrial usher protein  46.53 
 
 		 826 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2496  fimbrial usher protein  50.54 
 
 		 882 aa  838    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3153  fimbrial usher protein  50.86 
 
 		 881 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.112503 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3270  fimbrial usher protein  50.62 
 
 		 881 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142463  normal  0.0139544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4146  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  56.12 
 
 		 846 aa  976    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2489  fimbrial usher family protein  51.5 
 
 		 880 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.45 
 
 		 832 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4106  fimbrial usher protein  40.38 
 
 		 830 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3222  fimbrial usher protein  40.57 
 
 		 833 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000448746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0653  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.69 
 
 		 832 aa  598  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3509  fimbrial usher protein  40.69 
 
 		 834 aa  595  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00630946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02916  predicted outer membrane usher protein  40.77 
 
 		 822 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.85 
 
 		 821 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02866  hypothetical protein  40.85 
 
 		 812 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.419634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02223  hypothetical protein  51.05 
 
 		 579 aa  588  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3247  fimbrial usher protein  39.21 
 
 		 829 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239063  normal  0.0404863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3261  fimbrial usher protein  39.4 
 
 		 829 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.313341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3363  fimbrial usher protein  39.21 
 
 		 829 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0678454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3198  fimbrial usher protein  39.21 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3184  fimbrial usher protein  39.4 
 
 		 829 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0808  fimbrial usher protein  38.16 
 
 		 816 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.404851  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00678  predicted outer membrane protein  37.97 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2937  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.56 
 
 		 819 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0766  fimbrial usher family protein  37.56 
 
 		 833 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0635  fimbrial usher family protein  37.76 
 
 		 833 aa  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0744  fimbrial usher family protein  37.44 
 
 		 833 aa  534  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2918  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.16 
 
 		 818 aa  532  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.528881  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00667  hypothetical protein  38.42 
 
 		 792 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4772  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 828 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1147  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 828 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1627  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 828 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.19 
 
 		 828 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1611  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.15 
 
 		 829 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0173282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1547  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.38 
 
 		 817 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160729  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1524  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.82 
 
 		 828 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2061  MrfC  35.04 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230274  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1654  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.04 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1897  fimbrial usher protein  34.92 
 
 		 813 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1910  fimbrial usher protein  34.92 
 
 		 813 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04794  porin PapC  33.09 
 
 		 820 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  29.68 
 
 		 878 aa  337  7e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  29.68 
 
 		 878 aa  337  7e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.68 
 
 		 878 aa  337  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.9 
 
 		 877 aa  336  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  29.29 
 
 		 863 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  29.73 
 
 		 878 aa  332  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  29.68 
 
 		 856 aa  324  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  29.99 
 
 		 840 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  30.37 
 
 		 809 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  30.11 
 
 		 839 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  30.09 
 
 		 809 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  30.25 
 
 		 809 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  30.25 
 
 		 809 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.19 
 
 		 859 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.29 
 
 		 837 aa  300  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  30.12 
 
 		 809 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  29.52 
 
 		 871 aa  296  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  30.37 
 
 		 873 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  30.37 
 
 		 888 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  30.37 
 
 		 888 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.63 
 
 		 840 aa  293  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  28.71 
 
 		 842 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  29.8 
 
 		 888 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  28.71 
 
 		 842 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  28.71 
 
 		 842 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  29.15 
 
 		 865 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  29.75 
 
 		 888 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  29.67 
 
 		 833 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.22 
 
 		 833 aa  289  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  29.21 
 
 		 870 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  29.34 
 
 		 851 aa  287  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  29.19 
 
 		 870 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  29.69 
 
 		 850 aa  286  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  28.5 
 
 		 863 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  28.39 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.86 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  28.39 
 
 		 838 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  29.1 
 
 		 870 aa  286  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.27 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  28.17 
 
 		 866 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  29.77 
 
 		 833 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  28.5 
 
 		 838 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  29.1 
 
 		 870 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>