129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0962 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0962  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  490  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0274  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 676 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  28.93 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  33.54 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0735  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 282 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  29.7 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0222  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2493  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  26.42 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  31.43 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  28.41 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1856  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.587316  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2549  radical SAM family protein  24.71 
 
 		 362 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  24.16 
 
 		 350 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 383 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1314  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.263305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  25.86 
 
 		 368 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 392 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 381 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 375 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  25.29 
 
 		 386 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 352 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  27.38 
 
 		 377 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 362 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 362 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  25.88 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3517  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.918389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  26.26 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14520  DNA repair photolyase  24.4 
 
 		 357 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 421 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 437 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  25.88 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  27.91 
 
 		 387 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1952  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 344 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  26.14 
 
 		 381 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 386 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 371 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 386 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  26.04 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 385 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 356 aa  48.5  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 294 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  23.81 
 
 		 387 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 353 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1181  radical SAM family protein  23.95 
 
 		 362 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  24.28 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.16 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  24.16 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6097  Radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  25 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0508  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 390 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 352 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  23.35 
 
 		 352 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 362 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2190  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 373 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>