44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2543 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 104 aa  207  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  36.76 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  41.67 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  32.58 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0227  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 488 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 403 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 433 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2441  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3082  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4148  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0797664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  39.22 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 256 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 101 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>