More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1818 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
563 aa  1160    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  64.27 
 
 
549 aa  730    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  64.09 
 
 
549 aa  725    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  64.63 
 
 
552 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  79.02 
 
 
605 aa  928    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  62.78 
 
 
547 aa  729    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  62.27 
 
 
550 aa  738    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  54.7 
 
 
549 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  57.28 
 
 
548 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  67.96 
 
 
568 aa  777    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  57.86 
 
 
550 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  64.09 
 
 
549 aa  726    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  55.89 
 
 
549 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  55.33 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  55.89 
 
 
549 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  53.68 
 
 
560 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  55.77 
 
 
552 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  53.8 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  52.7 
 
 
552 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  55.39 
 
 
550 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  54.28 
 
 
550 aa  594  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  53.16 
 
 
561 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  53 
 
 
549 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  51.21 
 
 
544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  53.9 
 
 
549 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  50.65 
 
 
554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 
553 aa  552  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  46.45 
 
 
571 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  46.38 
 
 
566 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  47.59 
 
 
562 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  46.4 
 
 
564 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  44.85 
 
 
566 aa  525  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  47.66 
 
 
605 aa  522  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  47.88 
 
 
540 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  47.96 
 
 
549 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  47.74 
 
 
546 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  46.72 
 
 
576 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  48.09 
 
 
546 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  47.96 
 
 
566 aa  519  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  46.64 
 
 
562 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  47.01 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  46.28 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  46.27 
 
 
564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  47.88 
 
 
540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  47.91 
 
 
546 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  47.12 
 
 
564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  47.88 
 
 
540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  46.2 
 
 
538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  46.64 
 
 
557 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  46.3 
 
 
538 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  46.87 
 
 
576 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  46.94 
 
 
561 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  47.27 
 
 
544 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  46.44 
 
 
539 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  45.01 
 
 
564 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  48.65 
 
 
579 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  46.58 
 
 
551 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  45.55 
 
 
565 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  47.76 
 
 
577 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 
843 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  46.32 
 
 
596 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  46.13 
 
 
565 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  45.8 
 
 
552 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  46.65 
 
 
601 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  46.56 
 
 
575 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  45.71 
 
 
560 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  45.72 
 
 
550 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  45.69 
 
 
560 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  45.65 
 
 
575 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  46.56 
 
 
575 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  46.56 
 
 
575 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  47.12 
 
 
562 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  45.69 
 
 
560 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  46.01 
 
 
575 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  46.01 
 
 
560 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  46.84 
 
 
543 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  46.11 
 
 
560 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  45.04 
 
 
568 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  45.47 
 
 
575 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  47.87 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  44.99 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3764  AMP-binding domain protein  45.17 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  45.29 
 
 
576 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  45.47 
 
 
576 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  45.16 
 
 
546 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  46.11 
 
 
576 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  46.01 
 
 
576 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  44.55 
 
 
602 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  45.11 
 
 
575 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  44.2 
 
 
574 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  45.39 
 
 
576 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  45.39 
 
 
576 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  46.8 
 
 
572 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  45.39 
 
 
576 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  45.39 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  44.69 
 
 
570 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  45.34 
 
 
576 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  44.84 
 
 
1043 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  46.76 
 
 
577 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  45.39 
 
 
576 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>