119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1688 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  59.61 
 
 
203 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  43.38 
 
 
223 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  41.24 
 
 
199 aa  158  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  40.5 
 
 
193 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  40 
 
 
197 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  40.98 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  39.71 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  40 
 
 
195 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.9 
 
 
199 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  34.84 
 
 
190 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  34.84 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  36.45 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  132  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.73 
 
 
195 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  38.42 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  37.75 
 
 
196 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  35.96 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  34.48 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  39.3 
 
 
200 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  36.19 
 
 
214 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.35 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  33.49 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  33.81 
 
 
206 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  35.12 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  35.24 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  33.66 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.98 
 
 
193 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  35.98 
 
 
198 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  31.68 
 
 
197 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  34.47 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  33.33 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  92  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  41.96 
 
 
119 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  41.96 
 
 
119 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  31.63 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  30.26 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  32.04 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  40.54 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  41.12 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  24.75 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  25.25 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  24.75 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  25.26 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  39.13 
 
 
71 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  41.38 
 
 
72 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  36.62 
 
 
76 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  35.71 
 
 
75 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  47.92 
 
 
75 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  47.92 
 
 
76 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  53.19 
 
 
75 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  38.6 
 
 
76 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  45.83 
 
 
76 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  43.75 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  45.9 
 
 
76 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  45.9 
 
 
76 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.86 
 
 
77 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  36.71 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  39.71 
 
 
74 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  45.83 
 
 
75 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.88 
 
 
75 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  41.79 
 
 
69 aa  45.1  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  35.71 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  35.71 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  35.71 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  45.83 
 
 
75 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  45.83 
 
 
75 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  49.02 
 
 
82 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  43.75 
 
 
75 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  36 
 
 
83 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  37.93 
 
 
77 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  39.58 
 
 
75 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  35.82 
 
 
73 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  43.75 
 
 
78 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.29 
 
 
77 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  30.14 
 
 
81 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  36.51 
 
 
82 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  28.57 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  33.78 
 
 
76 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>