268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1905 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  100 
 
 		 76 aa  156  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  49.21 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  50 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  41.54 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  49.23 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  43.94 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  51.85 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  47.69 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  46.27 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  36.11 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  44.62 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  47.69 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  41.79 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  50 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  43.08 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  43.64 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  52.83 
 
 		 75 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  52.83 
 
 		 75 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.36 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.85 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  46.97 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  38.81 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  37.31 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  46.67 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  46.97 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  40.3 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  45.28 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  45.45 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  38.81 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  45.45 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.54 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  43.08 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  45.28 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  45.28 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  45.28 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  49.06 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  45.28 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  45.28 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  45.28 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  38.46 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  46.77 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  40.85 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  45.28 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.9 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  42.42 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  37.31 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  46.77 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  37.31 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  35.82 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.36 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  34.33 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  37.31 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  35.59 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  33.9 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  43.1 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  42.25 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.88 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  39.66 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  40 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  34.85 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  45.28 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  42.62 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  38.46 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  31.34 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  38.46 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  32.84 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  38.46 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  47.62 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>