More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0954 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0954  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0054169  hitchhiker  0.000000358715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  37.39 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  30.97 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  34.8 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  34.8 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  22.67 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.78 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1778  transcriptional regulator, LysR family  28.45 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  24.53 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  30.92 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  33.48 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1696  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  33.18 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1621  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1691  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  31.95 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2958  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>