More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0564 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0564  histidine kinase  100 
 
 
368 aa  738    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
358 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0641  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
450 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0148  histidine kinase-related ATPase, putative  28.76 
 
 
289 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10700  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
451 aa  113  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
440 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  30.84 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
742 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  25 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.47 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.63 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30.09 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  23.64 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.22 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  33.51 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  25 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  25 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  29.77 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.64 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  35.32 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.73 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
869 aa  76.3  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  30.81 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  25.94 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31.88 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  32.52 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  24.6 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31.88 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  26.14 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  24.35 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  28.64 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  31.88 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.71 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  32.16 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  31.55 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.19 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  29.3 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  34.83 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  23.34 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.37 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.61 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  28.57 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  31.56 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  28.23 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.47 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  28.63 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
682 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  30.94 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  22.5 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  29.02 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
464 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.17 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
638 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.68 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  28.7 
 
 
501 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  29.25 
 
 
515 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  27.1 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  31.6 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  28.5 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  30.22 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.38 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  32.35 
 
 
622 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  34.7 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.16 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.16 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.13 
 
 
726 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.04 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  31.96 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.16 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>