284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2152 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01463  hypothetical protein  99.74 
 
 		 382 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2141  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  99.74 
 
 		 382 aa  782    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000830223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01475  hypothetical protein  99.74 
 
 		 382 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.690608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1589  fimbrial usher family protein  99.74 
 
 		 382 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2152  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 382 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  97.91 
 
 		 871 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2118  fimbrial usher family protein  98.17 
 
 		 740 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.167309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  56.54 
 
 		 878 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  56.54 
 
 		 878 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  56.54 
 
 		 878 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  56.28 
 
 		 856 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  56.54 
 
 		 878 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  56.02 
 
 		 863 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4914  outer membrane usher protein FimD, truncation  61.19 
 
 		 286 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.99 
 
 		 877 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.42 
 
 		 876 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  40.46 
 
 		 866 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  42.19 
 
 		 873 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  40.46 
 
 		 866 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.46 
 
 		 866 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  42.19 
 
 		 888 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  42.19 
 
 		 888 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  40.46 
 
 		 866 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1049  outer membrane usher protein fimD-like protein  40.46 
 
 		 866 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.607471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  40.21 
 
 		 866 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  41.93 
 
 		 888 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.56 
 
 		 833 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  41.67 
 
 		 888 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  41.99 
 
 		 870 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  41.71 
 
 		 870 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  41.71 
 
 		 870 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  41.44 
 
 		 870 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  41.44 
 
 		 870 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  39.18 
 
 		 866 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  38.87 
 
 		 869 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.87 
 
 		 869 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  38.87 
 
 		 869 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  38.87 
 
 		 869 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  38.87 
 
 		 869 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  38.87 
 
 		 869 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.07 
 
 		 867 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  38.89 
 
 		 842 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  38.89 
 
 		 842 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  38.89 
 
 		 842 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.55 
 
 		 837 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  37.78 
 
 		 851 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.45 
 
 		 840 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5161  fimbrial usher protein  35.96 
 
 		 844 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.711297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  36.76 
 
 		 839 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.84 
 
 		 851 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  35.95 
 
 		 840 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  35.71 
 
 		 848 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0199  outer membrane usher protein FimD  35.71 
 
 		 848 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.548141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0191  outer membrane usher protein FimD  35.71 
 
 		 848 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0190  outer membrane usher protein FimD  35.71 
 
 		 848 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.536682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  35.16 
 
 		 848 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  35.49 
 
 		 838 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  35.21 
 
 		 838 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.21 
 
 		 838 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  35.21 
 
 		 863 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  35.21 
 
 		 838 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5006  outer membrane usher protein SfmD  34.1 
 
 		 809 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4917  outer membrane usher protein SfmD  34.1 
 
 		 809 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  35.21 
 
 		 838 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5003  outer membrane usher protein SfmD  34.1 
 
 		 809 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4844  outer membrane usher protein SfmD  34.1 
 
 		 809 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4951  outer membrane usher protein SfmD  34.1 
 
 		 809 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.93 
 
 		 838 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.33 
 
 		 871 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.27 
 
 		 859 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1531  outer membrane usher protein PsaC precursor  32.96 
 
 		 823 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00459102  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2676  fimbrial usher protein  32.96 
 
 		 823 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.529958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  32.49 
 
 		 836 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2757  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.83 
 
 		 823 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  32.2 
 
 		 836 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  32.2 
 
 		 836 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  31.92 
 
 		 836 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.53 
 
 		 901 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  28.53 
 
 		 901 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1889  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.49 
 
 		 831 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  30 
 
 		 870 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  29.62 
 
 		 814 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.97 
 
 		 861 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.64 
 
 		 870 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2228  outer membrane usher protein fimD  28.74 
 
 		 837 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531557  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.19 
 
 		 866 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.06 
 
 		 850 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  29.25 
 
 		 1040 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.03 
 
 		 880 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.65 
 
 		 872 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.21 
 
 		 884 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.57 
 
 		 857 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  28.16 
 
 		 872 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  27.54 
 
 		 868 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2037  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.54 
 
 		 837 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367837  normal  0.304513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0300  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.88 
 
 		 850 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  26.89 
 
 		 839 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.75 
 
 		 844 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  31.49 
 
 		 865 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.64 
 
 		 852 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>