More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0347 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 323 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 323 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 323 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  59.56 
 
 		 329 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  61.83 
 
 		 324 aa  355  5e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  57.05 
 
 		 329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  57.05 
 
 		 329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1229  sugar ABC transporter permease  53.61 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.446632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  44.2 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  44.2 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  43.89 
 
 		 329 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  44.88 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  43.83 
 
 		 343 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  45.07 
 
 		 344 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3637  monosaccharide-transporting ATPase  43.62 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3561  monosaccharide-transporting ATPase  43.23 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  38.82 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  36.65 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  36.19 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  34.57 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  36.91 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.47 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.1 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.89 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.89 
 
 		 310 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.89 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 835 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  32.8 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.12 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.17 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.69 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  31.53 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  34.52 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.08 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.43 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  34.42 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  34.42 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  28.34 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  30.23 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.41 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  32.23 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>