272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0859 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 414 aa  852    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  22.72 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.44 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  22.81 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  23.34 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  23.34 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  23.26 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  24.65 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.35 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.92 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  24.11 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  22.02 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0864  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.412848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  23.91 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  23.27 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.98 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  21.98 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.98 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.98 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  21.98 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  21.98 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  21.57 
 
 		 554 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  23.79 
 
 		 560 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.43 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  21.98 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 557 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  23.69 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  24.53 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  22.25 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.49 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  21.98 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  24.94 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 		 662 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1821  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120027  normal  0.196982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  22.41 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  23.12 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  22.78 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  20.18 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  21.93 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  23.98 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  24.81 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  23.21 
 
 		 559 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  22.95 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.47 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  21.03 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  23.36 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.19 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  20.89 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  22.6 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  21.9 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  22.39 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  24.38 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0950  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  22.57 
 
 		 561 aa  66.6  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  23.46 
 
 		 647 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  23.58 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  22.86 
 
 		 618 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  23.24 
 
 		 555 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  24.01 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  24.41 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  23.11 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  22.71 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  23.97 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>