250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1981 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  81.71 
 
 		 179 aa  305  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  78.03 
 
 		 179 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  71.59 
 
 		 179 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  68.93 
 
 		 179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  68.39 
 
 		 179 aa  254  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  62.11 
 
 		 169 aa  221  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  36.57 
 
 		 138 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  33.99 
 
 		 161 aa  84.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  32.68 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  34.04 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  34.03 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  33.57 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  33.57 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  33.57 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  34.23 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  35.33 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  34.46 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  36.05 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  32.91 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  35.88 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  31.82 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  35.46 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  31.33 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  32.9 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  35.88 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  35.88 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  35.11 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  33.12 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  29.61 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  32 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  35 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.65 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  34.35 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  34.29 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  31.21 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  32 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  31.21 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  33.11 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  32.14 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  30.82 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  34.35 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  33.33 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  31.06 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  33.57 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  32.62 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  35.16 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  32.87 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  31.91 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.13 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  32.87 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  29.93 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  35.16 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.62 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.58 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  36.15 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  32.39 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  32.88 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  32.62 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  33.58 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  30.87 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  35.16 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  31.91 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  30 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  34.72 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  30.67 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  29.29 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  28.03 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  31.43 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  29.29 
 
 		 160 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  31.62 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  26.35 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  30.61 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  28.67 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_826  bacterioferritin domain protein  32.59 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.5 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0839  rubrerythrin  32.09 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.170782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.5 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  30.15 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  30.34 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.12 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  30 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  30.37 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>