237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1563 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1563  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 399 aa  767    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  56.72 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  41.53 
 
 		 221 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 		 221 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  43.5 
 
 		 225 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  43.09 
 
 		 225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  41.13 
 
 		 222 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  39.77 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  41.06 
 
 		 218 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  42.91 
 
 		 228 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  40.24 
 
 		 219 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  37.69 
 
 		 222 aa  196  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  40.24 
 
 		 219 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  42.68 
 
 		 228 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  41.34 
 
 		 221 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  39.85 
 
 		 229 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  37.64 
 
 		 225 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  37.64 
 
 		 225 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  43.39 
 
 		 224 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 		 225 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  44.13 
 
 		 229 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  37.83 
 
 		 224 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 229 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  39.02 
 
 		 222 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  40.61 
 
 		 221 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  41.46 
 
 		 221 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  41 
 
 		 219 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 228 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  40.61 
 
 		 229 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  40.61 
 
 		 229 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  44.94 
 
 		 227 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 228 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  40.61 
 
 		 221 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  41.22 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  42.69 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  38.02 
 
 		 222 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  40.23 
 
 		 221 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  41.87 
 
 		 222 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.3 
 
 		 241 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  43.04 
 
 		 232 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  39.46 
 
 		 226 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 		 233 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  37.65 
 
 		 225 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  37.26 
 
 		 226 aa  186  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  37.65 
 
 		 225 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 		 261 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  45.67 
 
 		 255 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  41.46 
 
 		 218 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  42.62 
 
 		 220 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  37.93 
 
 		 220 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  37.65 
 
 		 225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  41.06 
 
 		 223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  41.87 
 
 		 226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  45.53 
 
 		 228 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  40.82 
 
 		 225 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  36.78 
 
 		 223 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  37.36 
 
 		 223 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  38.58 
 
 		 225 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  38.58 
 
 		 225 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  42.49 
 
 		 229 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  37.25 
 
 		 225 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  37.25 
 
 		 225 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  39.06 
 
 		 225 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  40.24 
 
 		 231 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  40.51 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  39.84 
 
 		 222 aa  182  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  39.31 
 
 		 231 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  40.08 
 
 		 225 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  44.49 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  42.91 
 
 		 229 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  36.09 
 
 		 225 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  36.4 
 
 		 216 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  38.91 
 
 		 222 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  38.19 
 
 		 225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  41.6 
 
 		 233 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  38.72 
 
 		 221 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  41.87 
 
 		 228 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  41.46 
 
 		 227 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  42.8 
 
 		 230 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 229 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 229 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 229 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 229 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  41.87 
 
 		 228 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  41.46 
 
 		 228 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  44.49 
 
 		 253 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  41.87 
 
 		 245 aa  179  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  38.93 
 
 		 229 aa  179  1e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  37.8 
 
 		 225 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  43.87 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.39 
 
 		 230 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  40.93 
 
 		 231 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  39.31 
 
 		 229 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  42.74 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  40.93 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>