More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1376 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
282 aa  563  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2054  phosphomethylpyrimidine kinase  80.44 
 
 
268 aa  394  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  75.37 
 
 
275 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  66.18 
 
 
269 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
265 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
266 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
285 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 
267 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
260 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
436 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
268 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.28 
 
 
277 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  50.74 
 
 
497 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
490 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
264 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
264 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  45.32 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
260 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.16 
 
 
262 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  44.74 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
268 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
267 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 
268 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 
270 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
284 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
267 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  51.13 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40.75 
 
 
272 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
268 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 
264 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
270 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 
268 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
283 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
270 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 
270 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.45 
 
 
288 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.45 
 
 
288 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.61 
 
 
263 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 
264 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  37.92 
 
 
273 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  46.44 
 
 
266 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  45.52 
 
 
268 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.62 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
270 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
267 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  44.87 
 
 
267 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  48.53 
 
 
269 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  43.25 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
269 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
270 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
270 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
270 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 
497 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  42.37 
 
 
270 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  46.52 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  44.03 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  38.01 
 
 
276 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  49.82 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  38.01 
 
 
276 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  47.41 
 
 
492 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
273 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  48.16 
 
 
269 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  48.16 
 
 
269 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
270 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
272 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0143  phosphomethylpyrimidine kinase  42.75 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  45.28 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.73 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  40.86 
 
 
510 aa  179  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
268 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.98 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  39.77 
 
 
270 aa  179  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  49.08 
 
 
269 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.66 
 
 
271 aa  178  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
267 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
265 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
283 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
274 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  46 
 
 
271 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
266 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  42.49 
 
 
288 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  39.86 
 
 
265 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  42.16 
 
 
531 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 
444 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  49.25 
 
 
267 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>