More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0513 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.6 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.03 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 237 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.92 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.04 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.91 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 195 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 195 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31.36 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31.36 
 
 		 239 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  31.67 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.3 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  27.92 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.91 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.31 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.14 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.3 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 255 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 236 aa  99  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 258 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 232 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 233 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 219 aa  95.5  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 248 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.26 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 255 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 239 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.26 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.26 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>