More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1014 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 149 aa  207  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  70.92 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  68.31 
 
 		 144 aa  199  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  64.71 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 150 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  65.44 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  187  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  65.93 
 
 		 148 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 147 aa  187  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  65 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  66.18 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  186  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  62.14 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 149 aa  186  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  186  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  62.32 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  64.96 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  63.5 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  61.03 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  61.27 
 
 		 142 aa  182  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>