More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0343 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0343  CinA domain protein  100 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  96 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  70.83 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  74.29 
 
 		 156 aa  154  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  81.91 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  66.67 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  67.8 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  78.41 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  75.51 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  77.01 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  77.01 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  69 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  77.01 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  77.01 
 
 		 166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  77.01 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  75.86 
 
 		 166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  69 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  60.16 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  67 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  69.9 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  66 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  66.99 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  66.99 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  54.96 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  65.05 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  60.19 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  80.21 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  58.42 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  58.65 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  60.2 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  58.59 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  66.67 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  60.48 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  65.93 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  67.78 
 
 		 140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  64.13 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  60.64 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  57.14 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  62.37 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  65.56 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  65.56 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  64.37 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  62.37 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  58.89 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  59.05 
 
 		 157 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  56.48 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  64.21 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  56.88 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  61.05 
 
 		 175 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  52.78 
 
 		 165 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  61.96 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  52.78 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  50 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  54.55 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  54.55 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  57.29 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  65.22 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  54.55 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  55.17 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0922  CinA-like protein  56.52 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  54.13 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  59.6 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  57.55 
 
 		 422 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  52.68 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  54.26 
 
 		 424 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  57.43 
 
 		 421 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  52.29 
 
 		 420 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  55.45 
 
 		 418 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  57.43 
 
 		 421 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  50.93 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  62.22 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  55.24 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  56.25 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  53.54 
 
 		 432 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  49.57 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  54.74 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  56.44 
 
 		 421 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  49.06 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  49.12 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  57.45 
 
 		 414 aa  104  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  48.15 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  44.96 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  49.12 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  52.21 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  55.45 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>