46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0205 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
252 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
229 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  27.44 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  26.98 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  32.32 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  35.85 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  27.36 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  32.7 
 
 
759 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  28.68 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  25.89 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  35.25 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  32.08 
 
 
703 aa  55.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  31.79 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  21.72 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  27.59 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
276 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  21.05 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  22.89 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
318 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  19.29 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  20.48 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.98 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  32.53 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  21.61 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>