44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3943 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
339 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  46.27 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  42.77 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  40.6 
 
 
354 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.82 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.55 
 
 
357 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.33 
 
 
347 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.29 
 
 
360 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.85 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 
355 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  36.36 
 
 
349 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.47 
 
 
355 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  33.54 
 
 
341 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  29.39 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  28.53 
 
 
328 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  28.97 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.95 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  28.16 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  26.85 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  25.28 
 
 
377 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
390 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  27.65 
 
 
387 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  27.75 
 
 
399 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  25.39 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  25.42 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.24 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.92 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  22.43 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.84 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.44 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  26.65 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  27.67 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0669  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.03 
 
 
300 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  26.94 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  26.26 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.5 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1645  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.89 
 
 
305 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0813074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2621  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.88 
 
 
630 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.204454 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0606  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.98 
 
 
299 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2912  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
630 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.379512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16770  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.98 
 
 
600 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0724  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.42 
 
 
622 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0532608  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2605  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.19 
 
 
618 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>