More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2871 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2871  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 509 aa  1050    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  73.08 
 
 		 508 aa  775    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.09 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.97 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  46.67 
 
 		 394 aa  323  6e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.12 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  46.24 
 
 		 382 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.24 
 
 		 398 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 388 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.19 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.85 
 
 		 392 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.55 
 
 		 392 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.18 
 
 		 388 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.27 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 394 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.82 
 
 		 379 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 398 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 398 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  44.84 
 
 		 388 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  43.2 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.09 
 
 		 394 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  43.34 
 
 		 390 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 398 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.87 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.63 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.19 
 
 		 383 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  42.51 
 
 		 403 aa  296  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 399 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.19 
 
 		 409 aa  296  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.71 
 
 		 396 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  42.51 
 
 		 395 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  43.28 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  43.61 
 
 		 389 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.76 
 
 		 1143 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  41.44 
 
 		 382 aa  293  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.73 
 
 		 396 aa  293  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  41.1 
 
 		 1139 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 		 388 aa  291  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  40.64 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 405 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.4 
 
 		 404 aa  289  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  42.63 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  41.29 
 
 		 398 aa  289  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 404 aa  289  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 		 405 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 407 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.95 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.95 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.95 
 
 		 407 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.73 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  47.08 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  41.13 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.73 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  42.22 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  41.44 
 
 		 379 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 384 aa  286  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  41.4 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  42.16 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.48 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.13 
 
 		 393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  41.53 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.91 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.48 
 
 		 384 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  41.11 
 
 		 414 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 410 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  40.21 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  40.21 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  41.94 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  42.51 
 
 		 404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  40.64 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  42.16 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>