More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2645 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 273 aa  524  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.06 
 
 		 273 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  70.48 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  69.12 
 
 		 271 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.12 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.1 
 
 		 269 aa  323  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.84 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.21 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.47 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.17 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.21 
 
 		 281 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.09 
 
 		 273 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.36 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.96 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.89 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.09 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.27 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.15 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.71 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.88 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.14 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.26 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.61 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.47 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.04 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.42 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.95 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.7 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.68 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.57 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.58 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.14 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.97 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.08 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.75 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.15 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.26 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.58 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.08 
 
 		 267 aa  149  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.48 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.52 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.64 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.72 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 271 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.51 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.74 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  37.77 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  38.5 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>