More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0907 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0907  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  473  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3657  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3268  ABC transporter related  53.72 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.110762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0034  ABC transporter related  54.4 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0927  ABC transporter related  51.01 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0131679  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000864  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter ATPase component  46.78 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06839  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.28 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1932  ABC transporter related  52.89 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185012  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0487  ABC transporter, ATP binding protein  48.61 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0645  ABC transporter, ATPase subunit  54.67 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2298  ABC transporter related  55.14 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.076659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0587  ABC transporter related  56.93 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2377  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1644  ABC transporter component  51.77 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0348832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  40.69 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  42.45 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  36.89 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.87 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  40.08 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  35.65 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  41.67 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  45.5 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.59 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  41.15 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  39.29 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  39.39 
 
 		 307 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.26 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  38.53 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.23 
 
 		 285 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  39.2 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  40.74 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  38.38 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  38.56 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  43.39 
 
 		 379 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  40.85 
 
 		 333 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  36.89 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  40.54 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  37.12 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  38.72 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.33 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  36.68 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  34.63 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  35.96 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  38.14 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  40.71 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  43.62 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  40.74 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  37.2 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  39.74 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2056  ABC transporter related  37.83 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  39.33 
 
 		 257 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  35.92 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  40.96 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  37.22 
 
 		 304 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  36.07 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  35.85 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  38.64 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  32.08 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  37.85 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  37.85 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  38.75 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  37.85 
 
 		 303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  40.61 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  39.27 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  37.76 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  33.94 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  40.19 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  38.26 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  38.6 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  38.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 365 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  35.4 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  41.32 
 
 		 312 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>