More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1092 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  71.03 
 
 
251 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  70.56 
 
 
223 aa  305  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.14 
 
 
226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.95 
 
 
223 aa  277  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  55.4 
 
 
218 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  55.4 
 
 
235 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  55.4 
 
 
235 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  54.46 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  55.14 
 
 
219 aa  231  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  54.88 
 
 
230 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  54.21 
 
 
219 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  52.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  52.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  52.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  52.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  52.56 
 
 
235 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  52.58 
 
 
218 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  52.58 
 
 
218 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.43 
 
 
237 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  55.14 
 
 
219 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  52.58 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  52.11 
 
 
218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  53.05 
 
 
228 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
219 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  53.21 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  53.99 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  53.99 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  53.99 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  53.74 
 
 
219 aa  211  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.05 
 
 
235 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  49.77 
 
 
219 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 
221 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
492 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 
493 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  49.76 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  47.44 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.46 
 
 
233 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 
216 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  46.7 
 
 
501 aa  191  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.41 
 
 
216 aa  191  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.52 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.75 
 
 
216 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.28 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
224 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 
226 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.19 
 
 
320 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 
226 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.19 
 
 
320 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.19 
 
 
320 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.19 
 
 
320 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
218 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  41.59 
 
 
222 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  40.49 
 
 
222 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  47.12 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  47.57 
 
 
320 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
503 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
220 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  47.09 
 
 
320 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.7 
 
 
485 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.7 
 
 
485 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.43 
 
 
222 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
222 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  41.04 
 
 
217 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.74 
 
 
221 aa  168  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 
337 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  37.79 
 
 
485 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.56 
 
 
513 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
334 aa  167  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  41.95 
 
 
222 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
222 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  41.9 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 
230 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 
230 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0469  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
246 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0815  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  0.0721562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
263 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 
268 aa  162  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>