248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1981 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
176 aa  360  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.57 
 
 
176 aa  278  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.16 
 
 
176 aa  269  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.73 
 
 
181 aa  254  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 
174 aa  246  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.93 
 
 
180 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.36 
 
 
180 aa  245  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.8 
 
 
180 aa  244  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.23 
 
 
180 aa  240  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
185 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
181 aa  238  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
181 aa  238  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
183 aa  238  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  238  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
182 aa  237  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.34 
 
 
180 aa  237  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
180 aa  237  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 
176 aa  236  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
176 aa  236  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.82 
 
 
181 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
178 aa  234  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 
178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 
177 aa  230  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
182 aa  229  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
182 aa  228  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
181 aa  228  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 
177 aa  228  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
178 aa  228  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 
177 aa  224  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
184 aa  223  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
183 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.94 
 
 
176 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
183 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
188 aa  220  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
181 aa  220  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  58.86 
 
 
180 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 
175 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
181 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.52 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  218  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  218  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
184 aa  218  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
184 aa  217  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 
190 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0843  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 
178 aa  217  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.60508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
176 aa  216  8.999999999999998e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
187 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
176 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
179 aa  215  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.96 
 
 
196 aa  215  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  59.09 
 
 
176 aa  215  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2124  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0456  20S proteasome A and B subunits  62.5 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
178 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3091  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
178 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
185 aa  214  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 
182 aa  214  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
180 aa  214  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
214 aa  214  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0603  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
177 aa  214  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  213  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
176 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0555  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1439  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.66 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.31 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
178 aa  210  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  60.8 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>