40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1442 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  49.63 
 
 
276 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  46.69 
 
 
281 aa  287  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.73 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  28.92 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  31.74 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  28.9 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  27.98 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  29.57 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  28.24 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  26.21 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  32.39 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  25.77 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  22.78 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  25.77 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  29.68 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  25.47 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  29.6 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.61 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  28.66 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  26.97 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  27.21 
 
 
142 aa  49.3  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  24.56 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30.95 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  32.22 
 
 
117 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  30.51 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  30.68 
 
 
124 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  27.84 
 
 
164 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  29.66 
 
 
172 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2114  hypothetical protein  34.52 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.88191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  32.53 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  25.23 
 
 
164 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  30.69 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  30.25 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  31.46 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  31.46 
 
 
124 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  30.69 
 
 
127 aa  42.7  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  26.89 
 
 
167 aa  42.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>