221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3180 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3180  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
838 aa  1670    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4297  TrkA domain-containing protein  43.26 
 
 
636 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  44.13 
 
 
637 aa  482  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2667  sodium/hydrogen exchanger  50.33 
 
 
767 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 
401 aa  127  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1689  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 
412 aa  115  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.91 
 
 
620 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3867  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 
429 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0872929  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1412  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.66 
 
 
574 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88925  Conserved hypothetical  30.87 
 
 
469 aa  101  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00702791  decreased coverage  0.00000780569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1135  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 
391 aa  95.5  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.813354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.67 
 
 
609 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.67 
 
 
609 aa  89  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.09 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.09 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.09 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.09 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.09 
 
 
609 aa  88.2  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 
617 aa  88.2  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.37 
 
 
609 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.22 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0560  hypothetical protein  26.98 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0030  Sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
610 aa  82.8  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.11 
 
 
612 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.34 
 
 
609 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.65 
 
 
628 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0147  Kef-type K+ transport system, membrane component  24.39 
 
 
577 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.127635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  23.08 
 
 
609 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 
219 aa  80.1  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  21.7 
 
 
611 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  25.86 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 
626 aa  67  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  22.38 
 
 
614 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  22.38 
 
 
614 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  23.09 
 
 
614 aa  64.7  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  25.65 
 
 
392 aa  64.3  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1726  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  27.59 
 
 
661 aa  63.9  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  30.26 
 
 
223 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.42 
 
 
221 aa  61.6  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  26 
 
 
618 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0091  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
397 aa  61.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  26.62 
 
 
619 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.59 
 
 
218 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 
852 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3767  PTS system, fructose-specific IIABC component  29.13 
 
 
619 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  28.35 
 
 
622 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  28.35 
 
 
619 aa  58.9  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  28.35 
 
 
626 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2757  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.93 
 
 
153 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.0278933 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0496  nitrogen regulatory IIA protein, PTS system  31.71 
 
 
148 aa  58.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0614  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.17 
 
 
153 aa  58.5  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  22.95 
 
 
218 aa  58.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.21 
 
 
618 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3482  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.56 
 
 
619 aa  57.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0610802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3744  PTS system, fructose-specific IIABC component  27.56 
 
 
618 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000405115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1486  PTS system, fructose-specific IIABC component  26.09 
 
 
618 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00732656  hitchhiker  0.00389815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3816  PTS system, fructose-specific IIABC component  26.81 
 
 
618 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0237  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.97 
 
 
154 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  25.64 
 
 
623 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 
218 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4310  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.65 
 
 
152 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2067  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.5 
 
 
153 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.08 
 
 
697 aa  54.7  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 
218 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4318  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.71 
 
 
152 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.243139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  26.87 
 
 
630 aa  54.7  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4296  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.71 
 
 
152 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3486  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
406 aa  53.9  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2893  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.17 
 
 
168 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  23.85 
 
 
458 aa  53.9  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  27.4 
 
 
650 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  22.09 
 
 
207 aa  53.5  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4165  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.79 
 
 
152 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  26.87 
 
 
630 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.52 
 
 
225 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0149  phosphotransferase system fructose-specific component IIB  28.18 
 
 
643 aa  53.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1539  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 
398 aa  53.5  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0928193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  29.76 
 
 
452 aa  52.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0588  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  24.77 
 
 
626 aa  52  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
448 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.48 
 
 
608 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.64 
 
 
458 aa  52  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0724  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.18 
 
 
652 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0740  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  27.18 
 
 
652 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  31.9 
 
 
450 aa  51.6  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3758  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  23.65 
 
 
634 aa  51.6  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
445 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
665 aa  51.2  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  24.91 
 
 
649 aa  51.2  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  24.88 
 
 
465 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  35.16 
 
 
499 aa  50.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0383  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  25 
 
 
620 aa  50.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00944668  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.46 
 
 
221 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.5 
 
 
157 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354162  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 
771 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3184  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.63 
 
 
682 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3931  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 
400 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393426  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0411  pts system, fructose-specific iiabc component  31.76 
 
 
625 aa  49.3  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>