118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1714 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  35.24 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  32.95 
 
 
244 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  36.13 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  33.12 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  28.94 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  30.07 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  26.8 
 
 
253 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  35.14 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  31.21 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  31.06 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  31.43 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  29.75 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  34.9 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  35.82 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  29.19 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  34.51 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  28.95 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  28.29 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  25.85 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  26.15 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  29.12 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  28.35 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  26.29 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  26 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  27.03 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0978  phosphorylase family protein  25.17 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000196702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  27.98 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0132  AMP nucleosidase  30.41 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.622836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  28.38 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  27.5 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  28.83 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0948  AMP nucleosidase  26.42 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.143571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  28.83 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  28 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  28.1 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  29.22 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  27.7 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  26.53 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  22.87 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  26.83 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  27.33 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  27.33 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  30.43 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  28.86 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  25.68 
 
 
287 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  31.61 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  27.7 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  23.63 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  29.75 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  23.53 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  25 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  28.57 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  26.83 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  27.54 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  30.34 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  23.9 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  26.32 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10970  purine-nucleoside phosphorylase  27.16 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0860305  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  29.66 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  27.7 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  25.62 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  26.38 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  28.66 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  26.22 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  34.85 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  34.85 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  25.61 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  26.28 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  27.92 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  34.33 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  25 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2357  purine or other phosphorylase family 1  22.02 
 
 
274 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  22.84 
 
 
272 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  26.85 
 
 
243 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  27.46 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  27.03 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  25.27 
 
 
232 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  25.17 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  25.32 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  24.16 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  26.54 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  25.45 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  21.51 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  25.35 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  26.22 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  27.27 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  25.93 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05118  purine nucleoside phosphorylase  24.06 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  21.32 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>