50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0551 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  54.34 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  49.81 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  42.8 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  35.85 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  34.13 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  32.39 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  43.31 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  38.16 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  38.52 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  30.41 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  38.28 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  37.5 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  38.02 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  30.66 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0414  hypothetical protein  30.36 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0132  AMP nucleosidase  31.29 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.622836  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  25.95 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  25 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  27.7 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  28.66 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  25 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0948  AMP nucleosidase  25.43 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.143571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  25.31 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  28.08 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  24.19 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  25.85 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  26.24 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  25.17 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  23.27 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2626  AMP nucleosidase  26.67 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  23.27 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  27.15 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  24.84 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  26.62 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  23.16 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  26.39 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  22.08 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  24.38 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3063  purine or other phosphorylase family 1  24.76 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  20.55 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  23.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  23.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  26.86 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  24.83 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  22.97 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  22.56 
 
 		 236 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>