131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0281 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  54.8 
 
 
256 aa  287  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  35.74 
 
 
252 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0414  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  35.96 
 
 
258 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  35.22 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  34.13 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  32.44 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  37.42 
 
 
264 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  27.6 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  33.06 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  30.41 
 
 
248 aa  79  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  26.57 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  23.62 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  30.5 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  25.9 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  25.44 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  32.48 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  29.34 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  27.08 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  27.33 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  29.34 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  26.46 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  28.57 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  28.91 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  26.95 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  27.61 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  29.27 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  23.22 
 
 
271 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  28.57 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  23.93 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  28.57 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  28.86 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  27.59 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  24.86 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  29.19 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  27.67 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  26.54 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  33.62 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  25 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  25.61 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  22.16 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  22.16 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  22.16 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  25.34 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  26.59 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  28.57 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  25.66 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  24.23 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  23.46 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  25.73 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  29.37 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  26.85 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  28.57 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  24.54 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  24 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  26.85 
 
 
278 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1596  purine phosphorylases family protein 1  28.97 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  26.14 
 
 
263 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  25.34 
 
 
235 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  26.14 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2626  AMP nucleosidase  30.68 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  22.58 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  24.84 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  24.84 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  26.36 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  26.45 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  26.56 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  33.75 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  23.65 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  37.68 
 
 
261 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  25.19 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  23.13 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  29.27 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  23.24 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  26.81 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  35.71 
 
 
261 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  30.43 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  22.39 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  22.29 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  25.95 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  22.54 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  23.88 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0978  phosphorylase family protein  25.7 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000196702  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  27.03 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  24.46 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  31.51 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  23.4 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  23.4 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>