213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0132 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0132  AMP nucleosidase  100 
 
 
289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.622836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  42.91 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0948  AMP nucleosidase  39.92 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.143571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  41.49 
 
 
256 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  39.54 
 
 
256 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  38.4 
 
 
287 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  37.59 
 
 
258 aa  191  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  39.84 
 
 
256 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  37.45 
 
 
277 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  38.89 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2626  AMP nucleosidase  35.95 
 
 
257 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  27.31 
 
 
389 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1823  AMP nucleosidase  28.52 
 
 
486 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1423  AMP nucleosidase  28.88 
 
 
484 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3127  AMP nucleosidase  29.6 
 
 
486 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2827  AMP nucleosidase  28.52 
 
 
485 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4942  AMP nucleosidase  28.62 
 
 
499 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2669  AMP nucleosidase  28.21 
 
 
482 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0986  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
382 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0708  AMP nucleosidase  28.37 
 
 
495 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  0.140174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0721  AMP nucleosidase  28.37 
 
 
495 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276805  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01894  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1671  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2824  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  0.783783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2167  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000113485  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2231  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.822424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1413  AMP nucleosidase  27.59 
 
 
494 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.43722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1143  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000908375  hitchhiker  0.00000131711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4743  AMP nucleosidase  28.22 
 
 
493 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2264  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000140487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2112  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000296443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2344  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0273914  hitchhiker  0.00120533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1661  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00901346  normal  0.0509963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2179  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00600152  normal  0.598678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2105  AMP nucleosidase  27.11 
 
 
484 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1215  AMP nucleosidase  28.52 
 
 
485 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0454  AMP nucleosidase  28.62 
 
 
497 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0681  AMP nucleosidase  28.97 
 
 
495 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114731  normal  0.0716932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3545  AMP nucleosidase  25.87 
 
 
506 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502164  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4233  AMP nucleosidase  27.34 
 
 
493 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00168339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4246  AMP nucleosidase  26.76 
 
 
493 aa  92.4  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1138  AMP nucleosidase  28.62 
 
 
491 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0641  AMP nucleosidase  28.27 
 
 
487 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133102  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4704  AMP nucleosidase  27.9 
 
 
484 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.591798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12490  AMP nucleosidase  28.62 
 
 
499 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2572  AMP nucleosidase  27.46 
 
 
484 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1846  AMP nucleosidase  27.24 
 
 
496 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4779  AMP nucleosidase  27.92 
 
 
487 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.549989  decreased coverage  0.00166711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4795  AMP nucleosidase  28.26 
 
 
487 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4337  AMP nucleosidase  28.27 
 
 
487 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.298005  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1955  AMP nucleosidase  26.9 
 
 
496 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4833  AMP nucleosidase  27.92 
 
 
487 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4655  AMP nucleosidase  27.92 
 
 
516 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370825  normal  0.206703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1488  AMP nucleosidase  26.71 
 
 
485 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3289  AMP nucleosidase  27.6 
 
 
489 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3750  AMP nucleosidase  27.54 
 
 
490 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.963566  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3569  AMP nucleosidase  26.22 
 
 
512 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0254113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5425  AMP nucleosidase  25.35 
 
 
496 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2704  AMP nucleosidase  26.69 
 
 
494 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.564034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1414  AMP nucleosidase  27.05 
 
 
504 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1387  AMP nucleosidase  26.79 
 
 
492 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0347338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0088  AMP nucleosidase  26.03 
 
 
499 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1155  AMP nucleosidase  25.61 
 
 
493 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0054  AMP nucleosidase  26.79 
 
 
492 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228346  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5885  AMP nucleosidase  25.35 
 
 
496 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2794  AMP nucleosidase  26.43 
 
 
483 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3701  AMP nucleosidase  26.22 
 
 
495 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0642  AMP nucleosidase  24.57 
 
 
498 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1201  AMP nucleosidase  25.96 
 
 
498 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3709  AMP nucleosidase  26.06 
 
 
493 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.456072  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0916  AMP nucleosidase  26.79 
 
 
499 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0206359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0485  AMP nucleosidase  26.06 
 
 
493 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09370  AMP nucleosidase  26.86 
 
 
490 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0214  AMP nucleosidase  24.04 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3922  AMP nucleosidase  24.31 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0404  AMP nucleosidase  26.07 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4036  AMP nucleosidase  24.31 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4957  AMP nucleosidase  24.83 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2800  AMP nucleosidase  26.16 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.955099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0658  AMP nucleosidase  25.78 
 
 
500 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1114  AMP nucleosidase  26.43 
 
 
500 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_004310  BR0623  AMP nucleosidase  26.33 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.625588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0602  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0622  AMP nucleosidase  26.33 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2656  AMP nucleosidase  25.98 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0963  AMP nucleosidase  26.69 
 
 
500 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2553  AMP nucleosidase  25.68 
 
 
508 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.325528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0408  AMP nucleosidase  24.4 
 
 
492 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3401  AMP nucleosidase  23.61 
 
 
517 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0546432 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4876  AMP nucleosidase  24.05 
 
 
526 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000501622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0167  AMP nucleosidase  26.69 
 
 
493 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0337  AMP nucleosidase  26.79 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0309  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0857  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0315968  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1489  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1685  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2416  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0341  AMP nucleosidase  25.34 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3658  AMP nucleosidase  26.07 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3869  AMP nucleosidase  26.07 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650151  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>