198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4378 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  98.5 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  59.22 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  56.69 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  52.65 
 
 		 292 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  47.71 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  51.53 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  38.96 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  36.8 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  38.69 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  30.18 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  35.82 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  31.45 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  29.11 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  27.27 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  26.95 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  32.87 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  27.43 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  30.53 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  30.77 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  30.13 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  28.88 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1575  purine nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  30.13 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  25.38 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  27.98 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  26.73 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  28.85 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  28.21 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  32.86 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  28.85 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.398843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  28.48 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  27.63 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  28.93 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  30.07 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  30.07 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  27.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  33.06 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  28.1 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  30.3 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  25.29 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  23.04 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  27.56 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  23.04 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  25.93 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  27.56 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  27.56 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  27.03 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3784  purine nucleoside phosphorylase  27.81 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  28.85 
 
 		 236 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  27.71 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  21.99 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  26.9 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  25.77 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  25.17 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  28.48 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4985  purine nucleoside phosphorylase  27.15 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  27.22 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4892  purine nucleoside phosphorylase  27.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4824  purine nucleoside phosphorylase  27.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  27.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  24.08 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  25.57 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  26.28 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3271  purine nucleoside phosphorylase  26.49 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  27.15 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  29.11 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>