65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4454 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  58.7 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  58.3 
 
 
273 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  52.65 
 
 
268 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  51.53 
 
 
268 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  48.19 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  52.44 
 
 
292 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  32.24 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  35.66 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  35.29 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  28.04 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  29.81 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  26.9 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  29.66 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  29.66 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  32.07 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  32.91 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  28.4 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  28.74 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  29.01 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  28.96 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  23.73 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  25 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  25.73 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  26.06 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  25.29 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  27.71 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  25.73 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  25.73 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  28.48 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  27.32 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  21.99 
 
 
236 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  24 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  26.54 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  29.45 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  25.77 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  24.57 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5885  AMP nucleosidase  25.33 
 
 
496 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  25.73 
 
 
238 aa  47  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  25.85 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1217  phosphorylase family protein  24.83 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0748  uridine phosphorylase  24.83 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  28.8 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  28.07 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  24.37 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_002950  PG0948  AMP nucleosidase  24.75 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.143571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  25.88 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  24.69 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5425  AMP nucleosidase  25.33 
 
 
496 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  24.68 
 
 
232 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  20.62 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  24.07 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  27.27 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  27.27 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  22.97 
 
 
238 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>