253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1081 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 252 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  33.76 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  39.07 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  37.62 
 
 		 261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  33.74 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  37.13 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  32.46 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  34.47 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2072  uridine phosphorylase  34.65 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00214406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  35.71 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  34.43 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  31.56 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  37.05 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  31.49 
 
 		 275 aa  131  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  34.63 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0392  uridine phosphorylase  32.08 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0403718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  35.09 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  30.81 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  34.63 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  34.63 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  37.31 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  37.31 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  30.74 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  35.68 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  34.78 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1651  uridine phosphorylase  33.66 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1831  uridine phosphorylase  32.83 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  32.34 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  33.02 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  34.17 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  32.62 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  32.32 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  31.16 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  30.81 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  30.04 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004006  uridine phosphorylase  28.38 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0962  purine or other phosphorylase family 1  29.44 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01516  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  30.58 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0460  uridine phosphorylase  30.5 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0552  uridine phosphorylase  30.3 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  27.23 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1546  purine phosphorylase family 1  31.58 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0539686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  27.95 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  27.95 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  27.07 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  27.07 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  27.07 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  32.26 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  27.07 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0461  uridine phosphorylase  31 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  27.51 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4509  uridine phosphorylase  29.5 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3074  uridine phosphorylase  28.07 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0126681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  27.39 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  28.43 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3390  uridine phosphorylase  28.5 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0060  purine phosphorylases family protein 1  33.82 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  29.29 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  30 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0488  uridine phosphorylase  29 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000843993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0491  uridine phosphorylase  29 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000989651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  26.75 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  26.75 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  26.75 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0467  uridine phosphorylase  29 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3852  uridine phosphorylase  29 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3932  uridine phosphorylase  28.57 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  28 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  28 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0187  uridine phosphorylase  29.29 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  28.5 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  29.95 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0606  purine-nucleoside phosphorylase  27.87 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  31.19 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  30.41 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  30.04 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  28.92 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  26.12 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  28.74 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  29.49 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0971  purine nucleoside phosphorylase  27.98 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0457  purine nucleoside phosphorylase  28.46 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001249  purine nucleoside phosphorylase  28.34 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0520  purine or other phosphorylase family 1  30.61 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3914  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2196  purine or other phosphorylase family 1  26.53 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>