102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0978 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0978  phosphorylase family protein  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0368  AMP nucleosidase  27.01 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  25.74 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1894  purine or other phosphorylase family 1  21.86 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000148802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1675  purine or other phosphorylase family 1  26.09 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  27.93 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0598  uridine phosphorylase  24.38 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  25.25 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  28.49 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  24.26 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0132  AMP nucleosidase  25.86 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.622836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1998  AMP nucleosidase  25.42 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1527  AMP nucleosidase  26.25 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2357  purine or other phosphorylase family 1  21.51 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0507  purine or other phosphorylase family 1  24.74 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  23.04 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  24.32 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  24.71 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  23.2 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  22.99 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  29.76 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.38 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  23.28 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  24.31 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  24.31 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2079  AMP nucleosidase  22.47 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0671255  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  24.54 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0938  purine or other phosphorylase family 1  22.11 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.686275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  21.99 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1519  uridine phosphorylase  22.7 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.03 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.03 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  24.57 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000334  N-Ribosylnicotinamide phosphorylase  23.67 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00958039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  25.58 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0062  purine phosphorylases family protein 1  23.46 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3962  uridine phosphorylase  23.27 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1305  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.74 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00324691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.42 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  21.82 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.47 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  19.23 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.86 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1003  purine nucleoside phosphorylase  22.38 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00510571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1606  purine or other phosphorylase family 1  21.07 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1385  purine or other phosphorylase family 1  20.42 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.534425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4352  uridine phosphorylase  21.81 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.72 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  24.52 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  28.39 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  23.26 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03718  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4148  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3403  uridine phosphorylase  20.99 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1240  uridine phosphorylase  22.56 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.719216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4055  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4352  uridine phosphorylase  22.28 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  25.7 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4177  uridine phosphorylase  22.28 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0246384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4208  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000492697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4303  uridine phosphorylase  22.28 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4248  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4295  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4176  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.82731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4199  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4355  uridine phosphorylase  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5272  uridine phosphorylase  22.28 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.25692  normal  0.111968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03667  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  21.3 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0266  uridine phosphorylase  28.17 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0244  uridine phosphorylase  21.54 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  23.58 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  39.06 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3646  uridine phosphorylase  28.17 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3950  uridine phosphorylase  28.17 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4122  uridine phosphorylase  27.67 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4137  uridine phosphorylase  27.67 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0948  AMP nucleosidase  21.74 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.143571 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0469  uridine phosphorylase  21.46 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0396786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1837  uridine phosphorylase  22.34 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.748158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1597  uridine phosphorylase  21.24 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.585092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0543  uridine phosphorylase  21.35 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00257097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1578  purine phosphorylase family 1  26.25 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00464289 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0900  uridine phosphorylase  28.39 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.768164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.21 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  26.13 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  26.13 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4133  uridine phosphorylase  22.47 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3505  uridine phosphorylase  22.95 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000185074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0447  uridine phosphorylase  22.95 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0162908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3680  uridine phosphorylase  22.95 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0823694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0412  uridine phosphorylase  21.52 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0375  uridine phosphorylase  23.76 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0370  uridine phosphorylase  23.76 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1473  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.35 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000544933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4067  uridine phosphorylase  26.76 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  20.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2868  uridine phosphorylase  25 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  21.82 
 
 		 232 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  28.07 
 
 		 244 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>