143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1488 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.63 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.31 
 
 
250 aa  241  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.44 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  42.74 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  42.74 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.15 
 
 
250 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  42.34 
 
 
260 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  41.94 
 
 
260 aa  214  8e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.15 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.1 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.34 
 
 
250 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.92 
 
 
258 aa  208  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.53 
 
 
250 aa  205  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.4 
 
 
251 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.45 
 
 
274 aa  202  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
250 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  42.98 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.56 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.5 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  42.39 
 
 
253 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.95 
 
 
146 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.6 
 
 
254 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.44 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.04 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
258 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.02 
 
 
259 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.24 
 
 
265 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
261 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
260 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.78 
 
 
260 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
263 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
261 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  27.85 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  30.12 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  29.44 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  30.65 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.21 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
249 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
258 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  32.11 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  29.55 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  31.06 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  32.84 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  33.17 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  28.85 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  32.87 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  24.06 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.08 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  30.89 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9286  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.98 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3613  putative ATP-binding protein  26.69 
 
 
319 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.67 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  26.91 
 
 
325 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.05 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3517  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.51 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0754  putative ATP-binding protein  26.34 
 
 
324 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  28.69 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4522  chromosome partitioning ATPase  25.26 
 
 
303 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  23.85 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  25.97 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
349 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  25.61 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174777  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  27.66 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  28.82 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  27.83 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.67 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  27.04 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  25.13 
 
 
340 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  25.42 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  26.02 
 
 
334 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  25 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0578  chromosome partitioning ATPase-like protein protein  26.34 
 
 
384 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2848  hypothetical protein  47.83 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.933644  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  27.64 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>