61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1429 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  29.19 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  24.3 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.99 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 191 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 253 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.11 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  27.48 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.51 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  27.91 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 568 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  25.69 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  26.04 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  22.35 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  26.7 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  25.76 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  26.23 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.37 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  26.7 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25.22 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  21.31 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0066  cAMP phosphodiesterase  31.68 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 226 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  26.13 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  23.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.81 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  21.57 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 484 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 200 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  22.31 
 
 		 229 aa  42.7  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  24.07 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>