68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0165 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  41.94 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1245  TfoX domain-containing protein  41.67 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  42.57 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1058  TfoX domain-containing protein  41.18 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0689  TfoX domain-containing protein  44.71 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  34.34 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  45.98 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  39.6 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  44.44 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  38.61 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1030  TfoX domain protein  37.38 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  34.82 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  46.59 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  35 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  46.59 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  46.59 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  47.73 
 
 		 349 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  44.32 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  44.32 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  34.69 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  36.84 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  32.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4881  TfoX domain-containing protein  36.54 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.834076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  35.42 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  34.69 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  32.99 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  31 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  40.23 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  34.48 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  38.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  38.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  37.08 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2526  TfoX-like  32.08 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00440124  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  31.25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  33 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  32.71 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  50 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  31.03 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  32.71 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1915  TfoX domain protein  32.5 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.950644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  31.11 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2122  TfoX domain protein  32.5 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  27.45 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  32.58 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1437  TfoX-like  41.07 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636984  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6391  TfoX domain-containing protein  41.07 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  30.28 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7055  TfoX domain-containing protein  41.07 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5704  TfoX domain-containing protein  40.54 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4760  TfoX domain-containing protein  34.12 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6951  TfoX-like protein  39.29 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  30.43 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  32.26 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1774  TfoX-like  29.41 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.831209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  33.33 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3570  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  25.68 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.73 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0216  TfoX domain-containing protein  32.1 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286393  normal  0.086439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  37.88 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  37.88 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>