40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0784 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  100 
 
 
349 aa  658    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  67.53 
 
 
219 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  67.53 
 
 
219 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  66.24 
 
 
223 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4340  TfoX domain-containing protein  87.31 
 
 
145 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910947  hitchhiker  0.000361795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4857  TfoX domain-containing protein  92.44 
 
 
141 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.854535  normal  0.0129035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3705  TfoX domain-containing protein  79.39 
 
 
133 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594494  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0837  hypothetical protein  62.86 
 
 
122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2219  TfoX, N-terminal  62.86 
 
 
122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1758  TfoX domain-containing protein  63.81 
 
 
121 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0877  TfoX domain-containing protein  62.86 
 
 
122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0969  TfoX domain-containing protein  62.86 
 
 
122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0060  hypothetical protein  62.86 
 
 
122 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3659  TfoX domain protein  45.65 
 
 
155 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3336  TfoX domain protein  45.65 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  42.17 
 
 
152 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3972  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129557  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0108  TfoX domain protein  40.86 
 
 
126 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2987  TfoX-like  36.67 
 
 
133 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0478922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  47.73 
 
 
110 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2753  TfoX domain protein  37.78 
 
 
168 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150667  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  22.69 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  38.95 
 
 
120 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0240  TfoX-like  40.91 
 
 
192 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0251  TfoX domain protein  37.5 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0262  TfoX domain protein  37.65 
 
 
206 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0114  TfoX domain-containing protein  35.53 
 
 
134 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0317949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0216  TfoX, N-terminal  34.78 
 
 
120 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  33.33 
 
 
108 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0262  TfoX domain-containing protein  35.87 
 
 
140 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0847  TfoX domain protein  30.12 
 
 
120 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1698  TfoX domain protein  34.34 
 
 
128 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.263995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6335  TfoX, N-terminal  30.11 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  44.9 
 
 
126 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3292  regulator of competence-specific genes-like protein  32.54 
 
 
132 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254917  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2248  TfoX domain-containing protein  27.37 
 
 
118 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809165  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  35.71 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4877  TfoX, N-terminal  29.41 
 
 
118 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311955  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  27.78 
 
 
114 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0665  TfoX-like  31.71 
 
 
171 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.917152  normal  0.475374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>